專書

1. 2023 《描かれた「故郷」─日本統治期における台湾美術の研究》。東京：東京大学出版会。
2. 2022 顏娟英、蔡家丘總策畫，顏娟英、蔡家丘、黃琪惠、楊淳嫻、魏竹君、邱函妮等合著，《臺灣美術兩百年（上）摩登時代、（下）島嶼呼喚》。臺北：春山。
3. 2020 顏娟英、蔡家丘、邱函妮、黃琪惠、楊淳嫻、張閔俞等合著，《不朽的青春—臺灣美術再發現》展覽圖錄。臺北：北師美術館。
4. 2004 《灣生．風土．立石鐵臣》。臺北：雄獅圖書。
5. 2002 邱函妮、王淑津、李欽賢、楊永智合著，《美術臺灣人》。臺北：遠流。

近五年期刊論文（具嚴格審查制度）

1. 2023 〈日治前期臺灣「美術」概念的移植與形成—以博覽會與官方展覽會為探討中心〉，《故宮學術季刊》，第41卷第1期（2023年9月），頁107-161。
2. 2021 〈美術史、展示與認同—在時代中載浮載沉的「臺灣美術」〉，《藝術學研究》，第29期（2021年12月），頁71-118。

近五年專書論文

1. 2022 〈關於陳植棋2020年修復作品之介紹〉，收入林明賢主編，《修復一個時代—文化部藝術品及相關檔案搶救修復寄存計畫》（臺中：國立臺灣美術館），頁12-39。
2. 2022 〈從陳澄波與一九二〇年代的臺灣民族運動〉，收入《百年情書—文協時代的啟蒙告白》國立台灣文學館「百年情書．文協百年特展」展覽圖錄（臺北：前衛），頁82-93。
3. 2021 〈從兩件《真人廟》談起—陳植棋與倪蔣懷的美術活動〉，《走向世界—臺灣新文化運動中的美術翻轉力》展覽圖錄（臺北：臺北市立美術館），頁24-43。
4. 2021 林麗江、盧慧紋、施靜菲、邱函妮，〈藝術史研究的回顧與展望〉，收入耿立群主編，《深耕茁壯—台灣漢學四十年回顧與展望》（臺北：國家圖書館），頁427-470。
5. 2019 〈資料11：第11回 陳澄波與「東洋」的對話：以1937年《嘉義公園》為例 / 陳澄波の「東洋」との対話：1937年《嘉義公園》の視点から〉，收入《2019年度山口県立大学国際文化学部「アジア社会論」アジア共同体での対話報告書（一般財団法人ワンアジア財団寄付講義）》（山口：山口県立大学国際文化学部発行，2019.10.30），頁111-130。

近五年會議論文

1. 2022 〈呂基正與戰前日本關西畫壇〉，《2022年藝術史暨視覺文化國際學術研討會》（臺北：國立中央大學，2022年10月14日）。
2. 2022 〈如候鳥般飛翔—往返於臺北、廈門、神戶、東京的西畫家呂基正〉，《第五屆人流與跨境學術研討會》（臺北：中央研究院台灣史研究所，2022年10月28日）。
3. 2019 〈1920年代的東京美術留學生與臺灣民族運動─以陳植棋（1906-1931）為例〉，《「近現代東亞美術史的新資料與新研究」工作坊》（臺北：福祿文化基金會，2019年12月6日）。
4. 2019 〈成為藝術家—陳植棋（1906-1931）研究〉，《「世界、地域及多元 當代視野下的臺灣藝術史重建臺灣藝術史」學術研討會》（文化部、國立臺灣大學藝術史研究所，2019年11月16日）。

翻譯

1. 2018 板倉聖哲，〈〈清明上河圖〉在東亞的傳播─以趙浙畫（林原美術館藏）為中心〉，收入《偽好物─16至18世紀蘇州片及其影響》展覽圖錄（臺北：國立故宮博物院）。
2. 2018 （共譯），小川裕充著，《臥遊—中國山水畫的世界》（臺北：石頭出版社）。
3. 2017 板倉聖哲，〈梁楷《出山釋迦圖》的諸問題〉，收入《浙江大學藝術與考古研究・特輯1（宋畫國際學術會議論文集）》（浙江：浙江大學），頁358-394。
4. 2017 《福岡亞洲美術館收藏品選100》（福岡：福岡亞洲美術館）。
5. 2016 竹內奈美子，〈日本工藝的軌跡―為本展鑑賞之導覽〉，收入《日本美術之最―東京、九州國立博物館精品展》展覽圖錄（臺北：國立故宮博物院）。
6. 2016 田澤裕賀，〈日本繪畫的歷史〉，收入《日本美術之最―東京、九州國立博物館精品展》展覽圖錄（臺北：國立故宮博物院）。
7. 2014 ラワンチャイクン寿子，〈官展的時代〉，收入《東京・ソウル・台北・長春―官展にみる近代美術》展覽圖錄（福岡亞洲美術館、府中市美術館、兵庫縣立美術館），頁245-248。
8. 2014 志賀秀孝，〈官展與在野―圍繞著南畫化之各自的交錯〉，收入《東京・ソウル・台北・長春―官展にみる近代美術》展覽圖錄（福岡亞洲美術館、府中市美術館、兵庫縣立美術館），頁233-235。
9. 2014 作品解説，《東京・ソウル・台北・長春―官展にみる近代美術》展覽圖錄（福岡亞洲美術館、府中市美術館、兵庫縣立美術館），頁233-235。
10. 2014 板倉聖哲，〈復原唐代壁畫之研究―以屏風壁畫為焦點〉，收入顏娟英、石守謙編，《藝術史中的漢晉與唐宋之變》（臺北：石頭出版社），頁257-280。
11. 2013 板倉聖哲，〈沈周早期繪畫制作之仿古意識―以《九段錦圖》冊為中心〉，《蘇州文博論叢》，第4期，頁146-153。
12. 2013 與林以珞共譯，兒島薫，〈1920-30年代日本油畫中對於『獨特性』的探究—在亞洲與歐洲之間〉，《國立臺灣大學美術史研究集刊》，第37期（2013年9月），頁43-66。
13. 2012 板倉聖哲，〈明代前期畫壇與雪舟〉，收入《明代浙派繪畫國際學術研討會論文集》（浙江：浙江人民美術出版社），頁283-295。
14. 2011 板倉聖哲，〈作為東亞圖象的瀟湘八景圖—十五世紀朝鮮前期文人所見到的東亞瀟湘八景圖〉，收入石守謙・廖肇亨編 ，《東亞文化意象之形塑》（臺北：允晨文化），頁167-190。
15. 2009 板倉聖哲，〈日本繪畫中的赤壁形象〉，《捲起千堆雪—赤壁文物特展》（臺北：國立故宮博物院），頁260-273。

策展

1. 臺北市立美術館「走向世界—臺灣新文化運動中的美術翻轉力」展覽，2021年10月2日–2021年11月28日（展覽顧問）。
2. 文化部・福祿文化基金會・北師美術館「不朽的青春──臺灣美術再發現」展覽，2020年10月17日–2021年1月17日（策展團隊成員）。

獲獎紀錄

1. 2023 以《描かれた「故郷」─日本統治期における台湾美術の研究》（東京：東京大学出版会，2023年）獲得第34回倫雅美術獎勵賞（美術史部門）
2. 2022 第三回東京大學而立賞（2022年度東京大學學術成果刊行助成）
3. 2021 109學年度臺灣大學教學優良獎
4. 2020 108學年度臺灣大學教學優良獎